，不能单纯地说哪个好，哪个不好。需视题主的生活态度、家庭情况而定。
生活态度
不管怎么说，从发展机会（如升值、加薪、择业等）、商业资源（如上游需求商、下游供应商、中游代理商等）、生活配套（如医院、学校、交通等）这些方面来看，上一级城市通常要比下一级城市好一些，甚至好很多。而对等的，其压力也会大许多，甚至大许多倍。如果你本人喜欢的生活，是富有挑战性的，能够不断突破自我的，并且具有一定的抗压能力，且具有越战越勇的精神，那么，二线城市可能更适合你。房贷和外债，不但不会成为你的生活压力，反而会成为你的精神动力。但如果你本人向往的是岁月静好现世安稳的日子，自然是回到三线城市，无房贷，有积蓄这样的日子，能让你过得更安心舒适。所以，归根结底，如何选择，要看个人的生活态度。
家庭情况
家庭情况又分：家庭收入情况，成员健康情况。如果家庭收入尚可，可以覆盖二线城市的所有开支，包括房贷、外债、日常开销，甚至一家老小的保险费、医疗费、保健费、兴趣爱好费等等，那其实更建议留在二线城市。因为如果你的生活态度是热爱挑战，那么留在二线城市会比留在三线城市，让你有更多挑战的机会。如果你的生活态度是向往平稳，那么二线城市虽看似有外债和房贷，但其实日子也不会太艰难。当然，这是最理想的状态。也不是所有人都有这个能力，买得起房，还得起贷，扛得住债，撑得起家。大部分情况是，家庭收入尚可，但并不足以覆盖留在二线城市上述所有开支，那么就要取决于你自己的生活态度。还有一部分情况是，家庭收入资不抵债，家庭成员健康情况堪忧，那么无论你是喜欢挑战的人，还是喜欢现世安稳的人，都还是建议回到三线城市吧。毕竟，这种状况下，本身就已经是巨大的挑战。并且，留在三线城市，也是对这种状况下的家庭，最负责也是最稳当的选择。综上，题主所描述的这种情况下，还需视个人生活态度和家庭情况，综合分析，再做决定。
以上，希望能对题主有所启发。
End
异乡人在深圳，陪你看世间。
还是应当留在二线城市。
首先，看教育。人生的大事最重要的莫过于两个：一是个人的事业发展，二是子女的教育。个人的发展空间，二线城市的发展机会大过三线城市，这是大概率发生的事情。更为重要的是子女教育的问题，大多数人不可能在事业上跟马云一样成为集大成者，大部分还是为家庭的幸福指数而工作，为子女的幸福成长而努力，其中，子女教育就是一个家庭最为重要的事情。“不让子女输在人生起跑线上”，这是大多数人人生的终极目标。而三线城市的教育资源不如二线城市，这个道理基本不会跑偏。
其次，看楼市。房地产长期看人口，二线城市人口净流入量总的是大于三线城市，房地产价值挤去泡沫后也是大于三线城市。按题中所述，因为房价水平不同，在二线城市买房要背几十万贷款，在三城买房按能力还能存几十万的存款。表面上，在三线买房更划算些，实际上，虽然三线城市的房子让你背负几十万贷款的压力，但从长远看，更能跑贏 CPI 上涨的，还应当是二线城市的房子。
第三，看工资水平。二线城市比起三线城市，不仅就业、创业的机会多些，而且工资水平高些、项目资源多些、提升自身的机会也多些。其中，大多数人关注还是工资水平。按题中的情况看，在二线城市有几十万房贷，还属正常，以二线城市的工资水平，还贷应当还是有可能的。
第四，看医疗资源。这个方面，也好理解。健康是人最大的财富，没有健康就没了一切。二线城市的医疗人才、医院数量及医疗机构质量，应当是优于三线城市。
一个人没啥钱时，从小城到大中城市发展，这样选择是明智的；一个人钱比较宽裕时，那就另当别论了。