襄阳被困，郭襄先去临安求援，未果后，然后转向川西寻找文天祥率领的抗元义军。城破，郭襄斩奸除孽，并将大宋三百年积累的财富藏匿，以备他日复国之用。崖山之战后，郭襄顿悟出家，在斩杀杨琏真迦时，被心智失常的郭破虏所伤后，溘然长逝。
话说南宋末年，昏君当道, 奸臣弄权，朝廷偏安一隅，此时的大宋已是岌岌可危。
南宋咸淳七年, 忽必烈建元称帝, 定都于大都，并拜吐蕃红教首领八思巴为国师，随后便开始了先取襄阳再攻临安的亡宋战略，翌年，蒙古大军复攻襄阳，并将之围困。
襄阳被困五年，黄蓉打造倚天剑与屠龙刀，并将九阴真经与武穆遗书藏于其中，随后郭靖命郭襄突围出城前往临安，请求援军。
丞相贾似道，玩乐为首、国事次之，拒不发兵。郭襄跪门固请三日，贾似道才敷衍了事，告知一月之内必发援兵，但三月已过，援兵却迟迟未发。
郭襄知襄阳情况紧急，于是求援于淮东制置使李庭芝，李庭芝欲私发水师入援襄阳，但贾似道竟命其门徒范文虎从中作梗，拒不出兵。
这时郭襄听闻，昔日被贾似道贬斥的文天祥，散尽家财，组建义军于川西抗击元军，遂马不停蹄地赶往川西。
谁知，刚到川西就传来襄阳失守、郭靖夫妇以身殉国、郭破虏与郭芙下落不明、屠龙刀遗失疆场、耶律齐与襄阳太守吕文焕降元的消息。
郭襄听到此消息后，恸哭数日不绝，文天祥也随哀之。郭襄知道，襄阳失守，临安便门户大开，城破就在旦夕之间。随后，郭襄与文天祥以勤王之名北上临安。
为保大宋血脉，襄、祥二人希望宋端宗赵昰能效仿当年蜀汉丞相诸葛亮三分天下之策略，迁都于易守难攻的成都，但端宗皇帝此时还欲苟且偷安，纵情声色，不愿意离开富庶的江南，前往蛮荒之地的蜀地。
郭襄再三跪请，端宗皇帝才在恋恋不舍之下，被文天祥护送潜出城外，逃往婺州，后又转到福州。
而郭襄则将大宋宫廷中三百年积累的无数财富珍宝，分成两批藏于南粤零丁洋与江西万安惶恐滩中，以备他日复国大宋之用。不久元军攻克临安，太皇太后与宋恭帝赵显相继被俘。
一切妥当之后，郭襄准备孤身潜入大都，决定刺杀蒙元皇帝忽必烈。途径武当，郭襄希望张君宝能与之同往，但是此时的张君宝武功尚未大成，如去大都反而适得其反。
之后郭襄又上终南山寻找神雕大侠杨过，但此时的杨过早已人莫知其所终。原来，襄阳城破后，郭靖夫妇以身殉国，杨过执手大哭，后临安失守，杨过见大宋奸党弄权, 谗佞侥幸，亡国乃迟早之事。
此时杨过已对大宋彻底失望，便生只有驱除鞑虏之心，而无恢复大宋河山之意，于是携妻小龙女远赴西域，暗中操纵抗元势力明教，以图新的汉室天下。
寻找杨过未果后，郭襄只身前往大都刺杀蒙元皇帝忽必烈。不料国师八思巴武功已到登峰造极、惊世骇俗的地步，郭襄失手正待被擒时，反被降元的前襄阳太守吕文焕所救。
郭襄大骂吕文焕忘恩负义，投敌偷生。吕文焕告知郭襄，襄阳被困六年，已如鸟飞路绝，早已被蒙元收买的大宋丞相贾似道，不仅不派援兵，还偷偷给忽必烈献言献策，以给耶律楚才平反为条件，策反了丐帮帮主耶律齐。
吕文焕有感郭襄之父郭靖侠之大者，以身殉国的精神，反恨大宋昏庸，为免襄阳被屠城，百姓生灵涂炭，于是降元攻宋，以出心中之怨气。
吕文焕转身离去，郭襄竟无言以对。
郭襄藏匿于大都后，正在思量吕文焕之言时，昔日给郭襄祝寿的江湖能人异士百草仙携其幼女来到了大都。
百草仙听完郭襄大都经历后，大骂吕文焕，降元可以情有可原，但助元攻宋却是因噎废食，郭襄听后深以为然。
百草仙此次来大都也是欲刺杀忽必烈，今见其守卫森严，于是转向准备刺杀蒙元重臣阿合马。
阿合马极善经商，独创的钞法乃是世界上最早的纯纸币，蒙元由此而军资充沛，以至蒙古铁骑横扫欧亚。百草仙将其女托付于郭襄后，假传太子之命召唤并刺杀，自己却在撤离时不幸遇难。
郭襄遂引百草仙之女暂避于幽州，途径晋地黄河风陵渡口，见黄河雄浑壮美，想起了昔日于此与杨过相遇，那时自己情窦初开，心如小鹿乱撞，当初还是潇洒明慧的少女，如今却已年近不惑，终日奔波却一事无成，为纪往者青春，忆昔之美，于是给百草仙之女取名风陵，并授其诗书兵法，风陵亦奉郭襄如母。
随后郭襄与风陵前往福建，斩杀奸臣贾似道于漳州木棉庵，范文虎听闻贾似道被杀，唯恐中原侠士找己寻仇，竟择船而遁至高丽，直至寿终正寝。
耶律齐降元后，忽必烈出于以汉制汉的考虑，对其极为器重，并扶持当上武林盟主。耶律齐也是不遗余力为蒙元效力，打击、威逼江湖各派，但中原有节气之人对其是嗤之以鼻，人所不齿。
耶律齐在君山召开大会，意欲率丐帮众人投靠蒙元，正待净衣派与污衣派争得不可开交之时，郭襄突然现身，用倚天剑将耶律齐斩杀。
就在郭襄斩奸除孽之时，文天祥却因势孤力单，于南粤五坡岭战败被俘，随后被押至大都。中原武林人士传檄四方，集聚兵马，欲前往大都劫狱解救文天祥并恭迎宋恭帝赵显回朝。
郭襄泣血而劝，此等劫狱，无异于加速文天祥的死亡。武林群雄还未前往大都，便被蒙元派兵剿灭，随后，忽必烈处死了拒不降元的文天祥。
此后，郭襄与风陵居于峨眉，行侠仗义。翌年，崖山海战，蒙元以少胜多，宋军全军覆灭，陆秀夫背少帝赵昺投海自尽，十万军民跳海殉国，南宋彻底灭亡。
不惑之年的郭襄见复国已经无望，于是顿悟出家，开创了峨眉派，但其之名是父母所命，心中还是不忍弃用。
八思巴弟子杨琏真迦，为灭汉人反抗之心，公然挖掘钱塘、绍兴多座南宋皇陵，并将尸骨暴露荒野，任风吹日晒，野兽噬咬，更有甚者，竟将帝后的遗骨制成骷髅碗，四处向人炫耀。
天下武林能人异士无不以杀杨琏真迦为生平之愿。郭襄手持倚天剑，光天化日下闯入杨琏真迦居所，十招内便取了杨琏真迦的性命。
就在被元廷鹰犬围攻之时，一道士横空而出，郭襄发现此道人居然是襄阳城破失踪的同胞兄弟郭破虏。
原来，襄阳城破，郭破虏重伤被俘。忽必烈欲取其性命，年迈的华筝公主据理力争，忽必烈无法，将郭破虏囚禁于极北的捕鱼儿海。
由于父母双亡，加之长年累月的思乡之情，郭破虏终于精神崩溃，以至心智失常。投靠于蒙元的全真教道士路过捕鱼儿海，虽精心医治，却未能痊愈，疯疯癫癫的郭破虏遂挽起发髻，跟随全真道士投入道家，字号百损道人，专心研习武学。
郭襄见到郭破虏如此模样，不禁泪流满面，只是不断地喊其乳名，却未曾还手，但心智失常的郭破虏还是将其打伤，正待郭破虏欲取其命时，神功大成的张三丰从天而降，三掌击退了郭破虏。
此时，郭破虏似乎依稀想起了旧日往事，立即停下手来，随后也是泪流满面，泣不能语，转身而去。
郭襄还是被郭破虏重伤，回到峨眉后，风陵侍奉汤药，衣不解带，郭襄手握倚天剑，默视良久，然后将刀剑秘密告知于风陵后，溘然长逝。
一代宗师郭襄女侠，就此红颜早逝。
按照武侠伦理是必须要救的。郭襄作为一个正派人物，必然会去。只是可能已经来不及了。以下是我的推测：
郭襄返回襄阳时，城中已是一片狼藉。她身着黑衣，趁夜潜入郭府。院子里有几个蒙古兵在篝火边饮酒，正前一间房子里有灯火，里面人影晃动，竟是外族装束。她心头一紧，因为这间屋子正是郭靖与黄蓉的卧室。莫非爹娘已遭遇不测？她取出一把暗器，运气击出，篝火旁的蒙古兵喉头中镖，登时扑倒。她跃至窗边，向里查看，泪水不觉倾泻而下。只见郭靖、郭破虏的头颅被放在桌上。而黄蓉和郭芙双手被反绑，蜷缩在地上，身上污秽不堪，似乎也已断气。有几个衣衫不整的蒙古军官正在喝酒取乐。她不觉怒火攻心，她从小到大一向开朗随和，从没有如此愤怒过。她一掌击破窗户，抽出短刀狂吼杀向蒙古兵，一时间血肉横飞。
郭襄把家人安葬在岘山堕泪杯前。想爹娘一代大侠，竟落得如此下场，不免有些怨恨上天不公。一身武艺有什么用？一身正气又有什么用？忠君爱国，民族优越感这些都有什么用？造化弄人，没有一丝丝怜悯；时代变迁，人甚至不如尘土。有情人比无情人承受更重的痛苦。她用短刀默默削去了自己的头发，决定跳出轮回，不再受这人世之苦。